深圳湾口岸的深港旅检大楼占地面积21641平方米，总高度23.42米，总建筑面积56677平方米，其中，深圳方占地29399平方米，香港方占地27278平方米。深圳方旅、货检单体建筑物共84项，香港方单体建筑物57项目。

深圳湾口岸的深港旅检大楼采用深港功能各自独立、型态荣为一体的设计，具有高度统一性；采用将旅检大楼沿南北向线型切割，使形体富有动态，中心区域采用起翘、舒展的漏孔飘板覆盖三层屋顶花园，并想南北延伸，构成旅检大楼深港双方的标志性入口，其产生的力度与飘逸，既符合交通建筑边界顺畅的特性，体现出海洋文化的轻灵与空透，满足了海岸建筑的抗台防爆要求。建筑的东西两翼亦反翘向外悬挑，外缘由斜向钢柱阵列支承，极富力度与韵律；外墙呈横向线条展开，虚实相间，简练、整洁，同时采用金属这样板，并使用耐腐蚀材料，使建筑的技术与艺术相辉映，弱化了巨大体量产生的压迫感和单调感，从而构成具有独特创意、标志性及观赏性具佳的口岸形象。该建筑的反翘造型及斜向阵列蜘蛛与深圳湾大桥产生极佳的呼应关系，更好地构造了西部通道建筑的整体形象。